保护区内爬行纲有2目，6科，10种。
I蜥蜴目 Lacertiformes
1. 鬣蜥科 Agamidae
（1）叶城沙蜥 Phrynocephalus axillaris Blanford
（2）变色沙蜥 Phrynocephalus versicolor Strauchi
2 壁虎科 Gekkonidae
（3） 隐耳漠虎 Alsophylax pipiens (Pallas)
（4）西域沙虎 Teratoscincus przewalskii Strauchi
3蜥蜴科Lacertidae
（5）密点麻蜥 Ereimas multiocellata Guenther
（6）虫纹麻蜥Ereimas vermiculata Blanford
II蛇目 Serpentiformes
4 蟒科 Boidae
(7)沙蟒 Eryx miliaris (Pallas)
5 游蛇科 Colubridae
（8）花条蛇 Psammophis lineolatus (Branbdt)
6蝰科Viperidae
（9）蝮蛇 Agkistrodon halys (Strauchi)
（10）高原蝮蛇 Agkistrodon strauchii Bedriage
鸟纲 Aves
保护区内鸟纲1988-1989年有15目，33科，108种；2002-2004年16目，30科，103种。
I 鸊鷉目 Podicipediformes
1鸊鷉科 Podicipedidae
（1）小鸊鷉Podiceps ruficollis (Pallas)
（2）凤头鸊鷉 Podiceps cristatus （Linnaeus）
II 鹈形目 Pleecaniformes
2鸬鹚科Phalacrocoracidae
（3）鸬鹚（+）* Phalacrocorax carbo Linnaeus
III鹳形目 Ciconiiformes
3 鹭科 Ardeidae
（4）苍鹭 Ardea cinerea Linnaeus
（5）大白鹭 Egretta alba (Linnaeus)
（6）大麻鳽 Botaurus stellaris (Linnaeus)
（7）黄斑苇鳽（+） Ixobrychus sinensis (Linnaeus)
4鹳科 Ciconiidae
（8）黑鹳（-） Ciconia nigra (Linnaeus)
IV 雁形目 Anseriformes
5鸭科 Anatidae
（9）灰雁 Anser anser (Linnaeus)
（10）豆雁（-） Anser fabalis Swinhoe
（11）斑头雁 Anser indicus (Latham)
（12）大天鹅（-） Cygnus cygnus (Linnaeus)
（13）赤麻鸭 Tadorna ferruginea (Pallas)
（14）针尾鸭 Anas acuta Linnaeus
（15）绿翅鸭 Anas crecca Linnaeus
（16）绿头鸭 Anas platyrhynchos Linnaeus
（17）斑嘴鸭 Anas poecilorhyncha Forster
（18）赤膀鸭 Anas strepera Linnaeus
（19）赤颈鸭 Anas Penelope Linnaeus
（20）琵嘴鸭 Anas clypeata Linnaeus
（21）红头潜鸭 Aythya ferina (Linnaeus)
（22）凤头潜鸭Aythya fuligula
（23）赤嘴潜鸭（+）Netta rufina
V 隼形目 Falconiformes
6鹰科Accipitridae
（24）鸢 （-）Milvus korschun (Gray)
（25）雀鹰（-）Accipiter nisus
（26）苍鹰（+）Accipiter gentilis
（27）普通鵟（+）Buteo buteo
（28）大鵟 Buteo hemilasius Temminck et Schlegel
（29）金雕 Aquila chrysaetos (Linnaeus)
（30）草原雕（+）Aquila nipalensis
（31）秃鹫（+）Aegypius monachus
（32）胡兀鹫Gypaetus barbatus
（33）鹗Pandion haliaetus
7. 隼科 Falconidae
（34）燕隼（-）Falco subbuteo
（35）黄爪隼（-）Falco naumanni
（36）红隼Falco tinnunculus
VI鸡形目 Galliformes
8. 雉科 Phasianidae
（37）石鸡Alectoris chukar
（38）高山雪鸡Tetraogallus himalayensis
（39）环颈雉Phasianus colchicus
VII 鹤形目 Gruiformes
9鹤科 Gruidae
（40）灰鹤 Grus grus
10 秧鸡科 Rallidae
（41）普通秧鸡（-） Rallus aquaticus
（42）骨顶鸡 Fulica atra
（43）黑水鸡（-） Gallicrex chloropus (Linnaeus)
11鸨科 Otididae
（44）小鸨（-）Otis tarda
VIII 鸻形目 Charadriiformes
12 鸻科Charadriidae
（45）凤头麦鸡 Vanellus vanellus (Linnaeus)
（46）灰斑鸻（-）Pluvialis squatarola
（47）金斑鸻Pluvialis dominica
（48）金眶鸻 Charadrius dubius Scopoli
（49）环颈鸻Charadrius alexandrinus
（50）蒙古沙鸻(-)Charadrius mongolus
13 鹬科Seolopacidae
（51）鹤鹬(-)Tringa erythropus
（52）红脚鹬Tringa totanus (Linnaeus)
（53）林鹬Tringa glareola
（54）矶鹬（-）Tringa hypoleucos
（55）翻石鹬（-）Arenaria interpres
（56）丘鹬(-)Scolopax rusticola
（57）白腰草鹬（+）Tringa ochropus
（58）扇尾沙锥 Capella gallinago (Linnaeus)
14反嘴鹬科Recurvirostridae
（59）黑翅长脚鹬Himantopus himantopus (Linnaeus)
IX 鸥形目Lariformes
15鸥科Laridae
（60）黑尾鸥（-） Larus crassirostris
（61）红嘴鸥（-） Larus ridibundus Linnaeus
（62）普通燕鸥 Sterna hirundo Linnaeus
X鸽形目 Columbiformes
16沙鸡科 Pterocllidiae
（63）毛腿沙鸡 Syrrhaptes paradoxus (Pallas)
17鸠鸽科 Columbidae
（64）岩鸽 Columba rupestris
（65）原鸽(-)Columba livia
（66）欧斑鸠(-)Streptopelia turtur
（67）灰斑鸠（+）Streptopelia decaocto
XI鹃形目 Cuculiformes
18杜鹃科Cuculidae
（68）大杜鹃 Cuculus canorus Linnaeus
XII 鸮形目 Strigiformes
19氏鸮科Strigidae
（69）雕鸮 Bubo bubo (Linnaeus)
（70）纵纹腹小鸮 Athene noctua (Scopoli)
（71）长耳鸮Asio otus (Linnaeus)
（72）短耳鸮（+）Asio flammeus (Pontoppidan)
XIII夜鹰目 Caprimulgiformes
20夜鹰科Caprimulgidae
（73）欧夜鹰（-） Caprimulgus europaeus Linnaeus
XIV雨燕目 Apodiformes
21雨燕科Apodidae
（74）楼燕 Apus apus (Linnaeus)
XV佛法僧目 Coraciiformes
22翠鸟科Alcedinidae
（75）冠鱼狗（+）Ceryle lugubris
23戴胜科 Upupidae
（76）戴胜 Upupa epops Linnaeus
XVI雀形目 Passeriformes
24百灵科 Alaudidae
（77）小沙百灵（-） Calandrella rufescens (Vieillot)
（78）凤头百灵 Galerida cristata (Linnaeus)
25燕科Hirundinidae
（79）灰沙燕 Riparia riparia (Linnaeus)
（80）家燕 Hirundo rustica Linnaeus
（81）岩燕Hirundo rupestris
26鹡鳹科Motacillidae
（82）黄鹡鸰（-） Motacilla flava Linnaeus
（83）山鹡鸰（+）Dendronanthus indicus
（84）灰鹡鳹 Motacilla cinerea Tunstall
（85）黄头鹡鳹 Motacilla citreola
（86）白鹡鳹 Motacilla alba Linnaeus
（87）田鷚Anthus novaeseelandiae (Gmelin)
27太平鸟科Bombycillidae
（88）太平鸟(-)Bombycilla garrulus
28伯劳科 Laniidae
（89）红背伯劳 Lanius collurio speculigerus Taczanowski
（90）灰伯劳Lanius excubitor
（91）红尾伯劳（+）Lanius crisastus Linnaeus
（92）楔尾伯劳（+） Lanius sphenocercus Cabanis
29椋鸟科 Sturnidae
（93）紫翅椋鸟(-)Sturnus vulgaris
30鸦科 Corvidae
（94）黑尾地鸦 Podoces hendersoni
（95）红嘴山鸦 Pyrrhocorax pyrrhocorax
（96）黄嘴山鸦（+）Pyrrhocorax graculus
（97）小嘴乌鸦（-） Corvus corone
（98）大嘴乌鸦（+）Corvus macrorhynchos
（100）渡鸦(-)Corvus corax
31岩鷚科 Prunellidae
（101）褐岩鷚 Prunella fulvescens (Severtzov)
32鹟科 Muscicapidae
（102）赭红尾鸲 Phoenicurus ochruros (Gmelin)
（103）红腹红尾鸲Phoenicurus erythrogaster
（104）欧亚红尾鸲（+）Phoenicurus phoenicurus
（105）贺兰山红尾鸲（+）Phoenicurus alaschanicus
（106）红胁蓝尾鸲（+）Tarsiger cyanurus
（107）沙鵖Oenanthe isabellina
（108）漠鵖Oenanthe deserti
（109）白顶鵖Oenanthe hispanica
（110）穗鵖（+）Oenanthe oenanthe
（111）白背矶鸫Monticola saxatilis
（112）赤颈鸫Turdus ruficollis
（113）虎斑地鸫（+）Zoohera dauma
（114）小蝗莺(-)Locustella certhiola
（115）东方大苇莺(-)Acrocephalus orientalis
（116）横斑林莺（+）Sylvia nisoria
（117）沙白喉林莺Sylvia minula
（118）黄腰柳莺（+）Phylloscopus proregulus
（119）漠莺Sylvia nana
（120）戴菊(-)Regulus regulus
33鳾科 Sittidae
（121）红翅旋壁雀 Tichodroma muraria (Linnaeus)
34文鸟科 Ploceidae
（122）黑顶麻雀 Passer ammodendri Gould
（123）树麻雀 Passer montanus (Linnaeus)
（124）家麻雀（+）Passer domesticus
35雀科Fringillidae
（125）黄嘴朱顶雀Acanthis flavirostris
（126）漠雀Rhodopechys dithagineus
（127）大朱雀(-)Carpodacus rubicilla
（128）沙色朱雀(-)Carpodacus synoicus
（129）高山岭雀(-)Leucosticte brandti
（130）红额金翅雀(-)Carduelis carduelis
（131）田鹀(-)Emberiza rustica
（132）灰眉岩鹀（+）Emberiza cia
（133）赤胸鹀（+）Emberiza fucata
（134）白头鹀（+）Emberiza leucocephala
（135）云雀（+）Alauda arvensis
哺乳纲 Mammalia
护区内哺乳纲动物1988-1989年有7目，13科，29种,2002-2004年有7目11科,21种。
I食虫目 Insectivora
1 胃科 Erinaceidae
（1）大耳胃 Hemiechinus auritus (Gmelin)
II 翼手目Chiroptera
2 蝙蝠科 Vespertilionidae
（2）北棕蝠 Eptesicus nilssoni
3犬吻蝠科Molossidae
（3）犬吻蝠 Tadarida plicata
III 兔形目Lagomorpha
4兔科Leporidae
(4) 草兔 Lepus capensis Pallas
5 鼠兔科 Ochotona
(5) 红耳鼠兔(+)Ochotona erythrotis
IV 啮齿目 Rodentia
6松鼠科Sciuridae
（6）旱獭Marmota bobak
7跳鼠科Dipodiae
（7）五趾跳鼠 Allaetaga sibirica (Forster)
（8）三趾跳鼠 Dipus sagitta (Pallas)
（9）戈壁五趾跳鼠 Allactaga bullata
（10）长耳跳鼠 Euchoreutes naso
（11）三趾心颅跳鼠（-）Salpingotus kozlovi
8鼠科Muridae
（12）小家鼠 Mus musculus Linnaeus
9仓鼠科 Cricetidae
（13）灰仓鼠Cricetulus migratorius
（14）大沙鼠Rhombomys opimus
（15）子午沙鼠Meriones meridianus
（16）柽柳沙鼠Meriones tamariscinus
（17）小毛足鼠Phodopus roborovskii
（18）东方田鼠（-）Microtus fortis
（19）鼹形田鼠（-）Ellobius talpinus
V 食肉目Carnivova
10鼬科Mustelidae
（20）虎鼬（-）Vormela peregusna
11犬科Canidae
（21）狼（-）Canis lupus
（22）赤狐（-）Vulpes vulpes (Linnaeus)
12猫科Felidae
（23）草原斑猫（-）Felis silvestris
（24）猞猁（-）Lynx lynx
（25）雪豹（-）Uncia uncia
VI奇蹄目Perissodactyla
13马科Equidae
（26）野驴Equus hemionus Pallas
VII偶蹄目Uncia uncia
14牛科Bovidae
（27）鹅喉羚Gazella subgutturosa
（28）盘羊Ovis ammon (Linnaeus)
（29）北山羊Capra ibex Linnaeus
（30）岩羊Pseudois nayaur(Hodgson)
*（+）是2002-2004年新增加的种类，（-）是1988-1989年见到的种类，而在2002-2004年没遇见。下同。